Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Jmjd8Q3TA59 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Jmjd8Q3TA59 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Jmjd8Q3TA59 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Jmjd8Q3TA59 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Jmjd8Q3TA59 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Jmjd8Q3TA59 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Jmjd8Q3TA59 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Jmjd8Q3TA59 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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