Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms