Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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