Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms