Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms