Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms