Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms