Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms