Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms