Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VegfaQ00731 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms