Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RptnP97347 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RptnP97347 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RptnP97347 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms