Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms