Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms