Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Lmo4P61969 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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