Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms