Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc13P50207 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms