Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms