Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chd1P40201 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms