Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PpardP35396 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PpardP35396 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PpardP35396 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpardP35396 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms