Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rab20P35295 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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