Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms