Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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