Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pabpc1P29341 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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