Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BgnP28653 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BgnP28653 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms