Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChgaP26339 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms