Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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