Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TP20293 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TP20293 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TP20293 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TP20293 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TP20293 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TP20293 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TP20293 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TP20293 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TP20293 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TP20293 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TP20293 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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