Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tnp1P10856 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms