Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hoxd3P09027 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms