Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06335 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06335 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06335 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06335 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06335 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06335 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06335 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06335 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06335 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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