Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ItgamP05555 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms