Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-Eb1P04230 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-Eb1P04230 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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