Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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