Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E2f6O54917 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms