Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3239L7N2D9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms