Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms