Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms