Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vmn1r58G3X9U3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms