Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms