Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Wdr77-201ENSMUST00000010278 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Tmem106a-202ENSMUST00000100403 2428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Spdye4b-201ENSMUST00000031574 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Amph-204ENSMUST00000200466 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Dpf3-207ENSMUST00000178756 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 March7-201ENSMUST00000067542 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cabs1-201ENSMUST00000008051 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Nnt-206ENSMUST00000223268 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Tctex1d1-206ENSMUST00000169211 1000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms