Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc146E9Q9F7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms