Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ccdc71lE9Q4T4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ccdc71lE9Q4T4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ccdc71lE9Q4T4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ccdc71lE9Q4T4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ccdc71lE9Q4T4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71lE9Q4T4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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