Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms