Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm4450E9Q007 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm4450E9Q007 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm4450E9Q007 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm4450E9Q007 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm4450E9Q007 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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