Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms