Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clip3B9EHT4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms