Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms