Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms