Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms