Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf4Q9QZS2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf4Q9QZS2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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